Protein–RNA interactions for Protein: P82673

MRPS35, 28S ribosomal protein S35, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS35P82673 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPS35P82673 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms