Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIM1P81133 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIM1P81133 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIM1P81133 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIM1P81133 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIM1P81133 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIM1P81133 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIM1P81133 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIM1P81133 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SIM1P81133 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIM1P81133 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIM1P81133 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIM1P81133 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIM1P81133 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIM1P81133 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SIM1P81133 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIM1P81133 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SIM1P81133 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIM1P81133 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIM1P81133 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIM1P81133 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIM1P81133 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SIM1P81133 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIM1P81133 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIM1P81133 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIM1P81133 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIM1P81133 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIM1P81133 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIM1P81133 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIM1P81133 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIM1P81133 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIM1P81133 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIM1P81133 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIM1P81133 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIM1P81133 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SIM1P81133 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIM1P81133 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIM1P81133 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIM1P81133 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIM1P81133 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIM1P81133 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIM1P81133 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIM1P81133 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIM1P81133 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIM1P81133 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SIM1P81133 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIM1P81133 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIM1P81133 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIM1P81133 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIM1P81133 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIM1P81133 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIM1P81133 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIM1P81133 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIM1P81133 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIM1P81133 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIM1P81133 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIM1P81133 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIM1P81133 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIM1P81133 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIM1P81133 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIM1P81133 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIM1P81133 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIM1P81133 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIM1P81133 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIM1P81133 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIM1P81133 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIM1P81133 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SIM1P81133 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIM1P81133 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIM1P81133 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIM1P81133 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIM1P81133 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIM1P81133 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIM1P81133 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SIM1P81133 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIM1P81133 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIM1P81133 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIM1P81133 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIM1P81133 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIM1P81133 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIM1P81133 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIM1P81133 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIM1P81133 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIM1P81133 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIM1P81133 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIM1P81133 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIM1P81133 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIM1P81133 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIM1P81133 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIM1P81133 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIM1P81133 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIM1P81133 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIM1P81133 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIM1P81133 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIM1P81133 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIM1P81133 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIM1P81133 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIM1P81133 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIM1P81133 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIM1P81133 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms