Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNRPEP62304 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms