Protein–RNA interactions for Protein: P61026

RAB10, Ras-related protein Rab-10, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB10P61026 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB10P61026 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB10P61026 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB10P61026 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB10P61026 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB10P61026 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB10P61026 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB10P61026 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB10P61026 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB10P61026 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB10P61026 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB10P61026 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB10P61026 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB10P61026 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB10P61026 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB10P61026 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB10P61026 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB10P61026 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB10P61026 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB10P61026 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB10P61026 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB10P61026 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB10P61026 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB10P61026 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB10P61026 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB10P61026 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB10P61026 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB10P61026 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB10P61026 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB10P61026 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB10P61026 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB10P61026 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB10P61026 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB10P61026 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB10P61026 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB10P61026 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB10P61026 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB10P61026 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB10P61026 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB10P61026 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB10P61026 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB10P61026 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB10P61026 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB10P61026 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB10P61026 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB10P61026 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB10P61026 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB10P61026 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB10P61026 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB10P61026 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB10P61026 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB10P61026 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB10P61026 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB10P61026 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB10P61026 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB10P61026 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB10P61026 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB10P61026 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB10P61026 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB10P61026 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB10P61026 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB10P61026 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB10P61026 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB10P61026 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB10P61026 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB10P61026 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB10P61026 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB10P61026 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB10P61026 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB10P61026 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB10P61026 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB10P61026 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB10P61026 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB10P61026 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB10P61026 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB10P61026 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB10P61026 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB10P61026 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB10P61026 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB10P61026 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB10P61026 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB10P61026 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB10P61026 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB10P61026 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB10P61026 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB10P61026 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB10P61026 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB10P61026 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB10P61026 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB10P61026 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB10P61026 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB10P61026 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB10P61026 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB10P61026 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB10P61026 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB10P61026 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB10P61026 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB10P61026 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB10P61026 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB10P61026 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 241.6 ms