Protein–RNA interactions for Protein: P59036

LINC00310, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00310, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00310P59036 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00310P59036 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00310P59036 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00310P59036 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms