Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 919.4 ms