Protein–RNA interactions for Protein: P55285

CDH6, Cadherin-6, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH6P55285 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH6P55285 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH6P55285 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH6P55285 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH6P55285 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH6P55285 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH6P55285 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH6P55285 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH6P55285 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH6P55285 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH6P55285 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH6P55285 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH6P55285 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH6P55285 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH6P55285 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH6P55285 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH6P55285 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH6P55285 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH6P55285 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH6P55285 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH6P55285 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH6P55285 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH6P55285 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH6P55285 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH6P55285 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH6P55285 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH6P55285 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH6P55285 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH6P55285 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH6P55285 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH6P55285 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH6P55285 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH6P55285 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH6P55285 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH6P55285 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH6P55285 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH6P55285 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH6P55285 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH6P55285 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH6P55285 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH6P55285 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH6P55285 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH6P55285 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH6P55285 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH6P55285 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH6P55285 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH6P55285 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH6P55285 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH6P55285 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH6P55285 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH6P55285 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH6P55285 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH6P55285 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH6P55285 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH6P55285 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH6P55285 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH6P55285 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH6P55285 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH6P55285 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH6P55285 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH6P55285 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH6P55285 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH6P55285 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH6P55285 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH6P55285 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH6P55285 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH6P55285 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH6P55285 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH6P55285 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH6P55285 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH6P55285 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH6P55285 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH6P55285 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH6P55285 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH6P55285 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH6P55285 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH6P55285 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH6P55285 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH6P55285 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH6P55285 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH6P55285 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH6P55285 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH6P55285 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH6P55285 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH6P55285 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH6P55285 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH6P55285 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH6P55285 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH6P55285 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH6P55285 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH6P55285 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH6P55285 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH6P55285 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH6P55285 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH6P55285 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH6P55285 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH6P55285 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH6P55285 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH6P55285 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH6P55285 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms