Protein–RNA interactions for Protein: P53985

SLC16A1, Monocarboxylate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A1P53985 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC16A1P53985 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms