Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGGT1BP53609 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
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