Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SUCLG1P53597 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SUCLG1P53597 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms