Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPC3P51654 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPC3P51654 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPC3P51654 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPC3P51654 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPC3P51654 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPC3P51654 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GPC3P51654 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPC3P51654 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GPC3P51654 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPC3P51654 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPC3P51654 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPC3P51654 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPC3P51654 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPC3P51654 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPC3P51654 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPC3P51654 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPC3P51654 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GPC3P51654 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPC3P51654 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPC3P51654 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPC3P51654 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPC3P51654 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GPC3P51654 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GPC3P51654 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GPC3P51654 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GPC3P51654 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
GPC3P51654 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
GPC3P51654 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GPC3P51654 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GPC3P51654 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GPC3P51654 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPC3P51654 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPC3P51654 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPC3P51654 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GPC3P51654 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPC3P51654 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPC3P51654 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPC3P51654 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPC3P51654 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPC3P51654 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPC3P51654 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPC3P51654 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPC3P51654 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPC3P51654 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPC3P51654 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPC3P51654 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPC3P51654 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPC3P51654 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPC3P51654 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPC3P51654 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPC3P51654 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPC3P51654 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPC3P51654 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPC3P51654 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPC3P51654 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPC3P51654 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GPC3P51654 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPC3P51654 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPC3P51654 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GPC3P51654 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPC3P51654 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPC3P51654 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPC3P51654 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPC3P51654 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPC3P51654 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPC3P51654 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPC3P51654 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPC3P51654 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPC3P51654 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPC3P51654 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPC3P51654 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPC3P51654 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPC3P51654 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPC3P51654 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPC3P51654 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPC3P51654 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPC3P51654 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPC3P51654 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GPC3P51654 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPC3P51654 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPC3P51654 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPC3P51654 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPC3P51654 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPC3P51654 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPC3P51654 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPC3P51654 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPC3P51654 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPC3P51654 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPC3P51654 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPC3P51654 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GPC3P51654 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GPC3P51654 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPC3P51654 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPC3P51654 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPC3P51654 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPC3P51654 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPC3P51654 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPC3P51654 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPC3P51654 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms