Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VEGFBP49765 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VEGFBP49765 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VEGFBP49765 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VEGFBP49765 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VEGFBP49765 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VEGFBP49765 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
VEGFBP49765 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VEGFBP49765 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VEGFBP49765 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VEGFBP49765 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VEGFBP49765 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VEGFBP49765 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
VEGFBP49765 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
VEGFBP49765 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
VEGFBP49765 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VEGFBP49765 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VEGFBP49765 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VEGFBP49765 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VEGFBP49765 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VEGFBP49765 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VEGFBP49765 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VEGFBP49765 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VEGFBP49765 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VEGFBP49765 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VEGFBP49765 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VEGFBP49765 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VEGFBP49765 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VEGFBP49765 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VEGFBP49765 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VEGFBP49765 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VEGFBP49765 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VEGFBP49765 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VEGFBP49765 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VEGFBP49765 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VEGFBP49765 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VEGFBP49765 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VEGFBP49765 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VEGFBP49765 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VEGFBP49765 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VEGFBP49765 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VEGFBP49765 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
VEGFBP49765 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VEGFBP49765 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VEGFBP49765 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VEGFBP49765 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
VEGFBP49765 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VEGFBP49765 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VEGFBP49765 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VEGFBP49765 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VEGFBP49765 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VEGFBP49765 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VEGFBP49765 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VEGFBP49765 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VEGFBP49765 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VEGFBP49765 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VEGFBP49765 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VEGFBP49765 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VEGFBP49765 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VEGFBP49765 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VEGFBP49765 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VEGFBP49765 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VEGFBP49765 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
VEGFBP49765 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VEGFBP49765 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VEGFBP49765 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VEGFBP49765 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VEGFBP49765 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VEGFBP49765 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VEGFBP49765 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VEGFBP49765 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VEGFBP49765 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
VEGFBP49765 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
VEGFBP49765 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VEGFBP49765 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VEGFBP49765 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VEGFBP49765 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VEGFBP49765 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VEGFBP49765 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VEGFBP49765 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VEGFBP49765 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VEGFBP49765 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VEGFBP49765 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VEGFBP49765 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
VEGFBP49765 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VEGFBP49765 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VEGFBP49765 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
VEGFBP49765 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
VEGFBP49765 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.57■■■□□ 2
VEGFBP49765 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
VEGFBP49765 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
VEGFBP49765 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
VEGFBP49765 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
VEGFBP49765 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VEGFBP49765 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VEGFBP49765 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VEGFBP49765 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VEGFBP49765 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VEGFBP49765 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VEGFBP49765 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms