Protein–RNA interactions for Protein: P41743

PRKCI, Protein kinase C iota type, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCIP41743 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCIP41743 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms