Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF4A3P38919 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF4A3P38919 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF4A3P38919 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF4A3P38919 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF4A3P38919 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF4A3P38919 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF4A3P38919 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF4A3P38919 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF4A3P38919 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF4A3P38919 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF4A3P38919 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF4A3P38919 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF4A3P38919 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF4A3P38919 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF4A3P38919 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF4A3P38919 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF4A3P38919 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF4A3P38919 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4A3P38919 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4A3P38919 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4A3P38919 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4A3P38919 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4A3P38919 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4A3P38919 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4A3P38919 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4A3P38919 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4A3P38919 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4A3P38919 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF4A3P38919 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF4A3P38919 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF4A3P38919 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF4A3P38919 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF4A3P38919 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF4A3P38919 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EIF4A3P38919 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF4A3P38919 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF4A3P38919 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF4A3P38919 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF4A3P38919 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF4A3P38919 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF4A3P38919 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF4A3P38919 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF4A3P38919 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF4A3P38919 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF4A3P38919 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF4A3P38919 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF4A3P38919 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF4A3P38919 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF4A3P38919 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF4A3P38919 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF4A3P38919 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF4A3P38919 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF4A3P38919 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF4A3P38919 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF4A3P38919 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF4A3P38919 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF4A3P38919 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF4A3P38919 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF4A3P38919 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF4A3P38919 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF4A3P38919 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF4A3P38919 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF4A3P38919 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF4A3P38919 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF4A3P38919 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF4A3P38919 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF4A3P38919 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF4A3P38919 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EIF4A3P38919 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EIF4A3P38919 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EIF4A3P38919 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EIF4A3P38919 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EIF4A3P38919 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms