Protein–RNA interactions for Protein: P35790

CHKA, Choline kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKAP35790 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHKAP35790 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHKAP35790 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHKAP35790 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHKAP35790 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CHKAP35790 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHKAP35790 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHKAP35790 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHKAP35790 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CHKAP35790 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHKAP35790 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHKAP35790 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHKAP35790 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHKAP35790 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHKAP35790 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHKAP35790 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CHKAP35790 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHKAP35790 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHKAP35790 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHKAP35790 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHKAP35790 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CHKAP35790 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHKAP35790 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHKAP35790 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHKAP35790 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHKAP35790 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHKAP35790 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHKAP35790 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHKAP35790 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHKAP35790 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHKAP35790 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHKAP35790 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHKAP35790 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHKAP35790 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHKAP35790 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHKAP35790 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHKAP35790 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHKAP35790 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHKAP35790 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHKAP35790 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHKAP35790 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHKAP35790 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHKAP35790 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CHKAP35790 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHKAP35790 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHKAP35790 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHKAP35790 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHKAP35790 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHKAP35790 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHKAP35790 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHKAP35790 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHKAP35790 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHKAP35790 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHKAP35790 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHKAP35790 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHKAP35790 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHKAP35790 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHKAP35790 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHKAP35790 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHKAP35790 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHKAP35790 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHKAP35790 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CHKAP35790 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHKAP35790 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHKAP35790 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHKAP35790 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHKAP35790 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHKAP35790 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHKAP35790 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHKAP35790 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHKAP35790 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHKAP35790 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHKAP35790 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHKAP35790 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHKAP35790 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHKAP35790 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHKAP35790 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHKAP35790 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHKAP35790 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHKAP35790 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHKAP35790 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHKAP35790 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHKAP35790 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHKAP35790 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHKAP35790 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHKAP35790 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHKAP35790 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHKAP35790 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHKAP35790 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHKAP35790 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHKAP35790 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHKAP35790 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHKAP35790 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHKAP35790 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHKAP35790 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHKAP35790 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHKAP35790 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHKAP35790 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHKAP35790 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHKAP35790 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms