Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
USP6P35125 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
USP6P35125 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
USP6P35125 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
USP6P35125 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
USP6P35125 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
USP6P35125 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC32.27■■■□□ 2.76
USP6P35125 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
USP6P35125 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
USP6P35125 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.76
USP6P35125 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
USP6P35125 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.76
USP6P35125 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
USP6P35125 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
USP6P35125 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
USP6P35125 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
USP6P35125 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
USP6P35125 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
USP6P35125 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
USP6P35125 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
USP6P35125 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
USP6P35125 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
USP6P35125 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
USP6P35125 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC32.24■■■□□ 2.75
USP6P35125 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
USP6P35125 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
USP6P35125 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
USP6P35125 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
USP6P35125 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
USP6P35125 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
USP6P35125 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
USP6P35125 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
USP6P35125 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
USP6P35125 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
USP6P35125 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
USP6P35125 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
USP6P35125 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
USP6P35125 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
USP6P35125 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
USP6P35125 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
USP6P35125 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
USP6P35125 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
USP6P35125 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
USP6P35125 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
USP6P35125 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
USP6P35125 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
USP6P35125 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
USP6P35125 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
USP6P35125 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
USP6P35125 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
USP6P35125 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
USP6P35125 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
USP6P35125 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
USP6P35125 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
USP6P35125 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP6P35125 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP6P35125 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP6P35125 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP6P35125 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP6P35125 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP6P35125 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP6P35125 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP6P35125 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
USP6P35125 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
USP6P35125 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
USP6P35125 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
USP6P35125 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
USP6P35125 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
USP6P35125 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
USP6P35125 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
USP6P35125 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
USP6P35125 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
USP6P35125 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
USP6P35125 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
USP6P35125 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
USP6P35125 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
USP6P35125 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
USP6P35125 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
USP6P35125 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
USP6P35125 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
USP6P35125 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
USP6P35125 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
USP6P35125 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
USP6P35125 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
USP6P35125 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
USP6P35125 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
USP6P35125 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
USP6P35125 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
USP6P35125 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
USP6P35125 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
USP6P35125 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
USP6P35125 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
USP6P35125 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
USP6P35125 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP6P35125 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP6P35125 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP6P35125 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP6P35125 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP6P35125 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP6P35125 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms