Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXA7P31268 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXA7P31268 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXA7P31268 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXA7P31268 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXA7P31268 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXA7P31268 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXA7P31268 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXA7P31268 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXA7P31268 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXA7P31268 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXA7P31268 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXA7P31268 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXA7P31268 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXA7P31268 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXA7P31268 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HOXA7P31268 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXA7P31268 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXA7P31268 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXA7P31268 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXA7P31268 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXA7P31268 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXA7P31268 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXA7P31268 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXA7P31268 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXA7P31268 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXA7P31268 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXA7P31268 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXA7P31268 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXA7P31268 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXA7P31268 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXA7P31268 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXA7P31268 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXA7P31268 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXA7P31268 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXA7P31268 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXA7P31268 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXA7P31268 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXA7P31268 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXA7P31268 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXA7P31268 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXA7P31268 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXA7P31268 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXA7P31268 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXA7P31268 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXA7P31268 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXA7P31268 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXA7P31268 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXA7P31268 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXA7P31268 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXA7P31268 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms