Protein–RNA interactions for Protein: P30203

CD6, T-cell differentiation antigen CD6, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD6P30203 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD6P30203 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD6P30203 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CD6P30203 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD6P30203 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD6P30203 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CD6P30203 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD6P30203 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD6P30203 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD6P30203 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD6P30203 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD6P30203 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD6P30203 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CD6P30203 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD6P30203 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD6P30203 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD6P30203 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CD6P30203 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD6P30203 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD6P30203 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD6P30203 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD6P30203 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD6P30203 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CD6P30203 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD6P30203 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CD6P30203 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD6P30203 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD6P30203 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD6P30203 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD6P30203 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD6P30203 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD6P30203 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD6P30203 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD6P30203 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD6P30203 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD6P30203 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD6P30203 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD6P30203 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD6P30203 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD6P30203 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD6P30203 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD6P30203 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD6P30203 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD6P30203 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CD6P30203 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD6P30203 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD6P30203 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD6P30203 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CD6P30203 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD6P30203 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD6P30203 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD6P30203 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD6P30203 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD6P30203 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD6P30203 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD6P30203 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD6P30203 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD6P30203 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD6P30203 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD6P30203 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD6P30203 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD6P30203 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD6P30203 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD6P30203 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD6P30203 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD6P30203 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD6P30203 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD6P30203 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CD6P30203 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD6P30203 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD6P30203 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CD6P30203 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD6P30203 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD6P30203 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD6P30203 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD6P30203 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD6P30203 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD6P30203 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD6P30203 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD6P30203 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD6P30203 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD6P30203 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD6P30203 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD6P30203 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD6P30203 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD6P30203 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD6P30203 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD6P30203 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD6P30203 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD6P30203 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD6P30203 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD6P30203 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD6P30203 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD6P30203 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD6P30203 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD6P30203 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD6P30203 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD6P30203 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD6P30203 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD6P30203 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms