Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTGFP29279 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CTGFP29279 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CTGFP29279 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTGFP29279 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CTGFP29279 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTGFP29279 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTGFP29279 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTGFP29279 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTGFP29279 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTGFP29279 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTGFP29279 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CTGFP29279 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CTGFP29279 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
CTGFP29279 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CTGFP29279 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CTGFP29279 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTGFP29279 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTGFP29279 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTGFP29279 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTGFP29279 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTGFP29279 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTGFP29279 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTGFP29279 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTGFP29279 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTGFP29279 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTGFP29279 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTGFP29279 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTGFP29279 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CTGFP29279 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTGFP29279 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CTGFP29279 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTGFP29279 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTGFP29279 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTGFP29279 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTGFP29279 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CTGFP29279 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTGFP29279 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTGFP29279 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTGFP29279 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTGFP29279 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTGFP29279 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CTGFP29279 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CTGFP29279 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CTGFP29279 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CTGFP29279 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTGFP29279 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTGFP29279 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTGFP29279 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CTGFP29279 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CTGFP29279 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTGFP29279 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTGFP29279 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTGFP29279 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTGFP29279 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTGFP29279 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTGFP29279 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTGFP29279 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CTGFP29279 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTGFP29279 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTGFP29279 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTGFP29279 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CTGFP29279 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTGFP29279 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTGFP29279 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CTGFP29279 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTGFP29279 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTGFP29279 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTGFP29279 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTGFP29279 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CTGFP29279 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTGFP29279 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTGFP29279 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CTGFP29279 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTGFP29279 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTGFP29279 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTGFP29279 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTGFP29279 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTGFP29279 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTGFP29279 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTGFP29279 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTGFP29279 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTGFP29279 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CTGFP29279 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CTGFP29279 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CTGFP29279 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTGFP29279 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTGFP29279 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTGFP29279 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTGFP29279 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTGFP29279 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTGFP29279 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTGFP29279 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTGFP29279 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTGFP29279 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTGFP29279 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTGFP29279 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTGFP29279 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTGFP29279 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTGFP29279 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms