Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GTF2E1P29083 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GTF2E1P29083 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GTF2E1P29083 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
GTF2E1P29083 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GTF2E1P29083 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GTF2E1P29083 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
GTF2E1P29083 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GTF2E1P29083 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GTF2E1P29083 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GTF2E1P29083 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GTF2E1P29083 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GTF2E1P29083 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GTF2E1P29083 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GTF2E1P29083 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GTF2E1P29083 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GTF2E1P29083 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GTF2E1P29083 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GTF2E1P29083 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GTF2E1P29083 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GTF2E1P29083 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GTF2E1P29083 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GTF2E1P29083 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GTF2E1P29083 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GTF2E1P29083 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GTF2E1P29083 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GTF2E1P29083 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GTF2E1P29083 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
GTF2E1P29083 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GTF2E1P29083 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GTF2E1P29083 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GTF2E1P29083 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GTF2E1P29083 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GTF2E1P29083 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GTF2E1P29083 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GTF2E1P29083 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GTF2E1P29083 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GTF2E1P29083 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GTF2E1P29083 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GTF2E1P29083 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GTF2E1P29083 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GTF2E1P29083 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GTF2E1P29083 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GTF2E1P29083 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
GTF2E1P29083 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
GTF2E1P29083 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GTF2E1P29083 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GTF2E1P29083 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GTF2E1P29083 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
GTF2E1P29083 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GTF2E1P29083 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GTF2E1P29083 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GTF2E1P29083 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GTF2E1P29083 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GTF2E1P29083 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GTF2E1P29083 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GTF2E1P29083 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GTF2E1P29083 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
GTF2E1P29083 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GTF2E1P29083 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GTF2E1P29083 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GTF2E1P29083 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GTF2E1P29083 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GTF2E1P29083 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GTF2E1P29083 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GTF2E1P29083 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GTF2E1P29083 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GTF2E1P29083 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GTF2E1P29083 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GTF2E1P29083 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GTF2E1P29083 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GTF2E1P29083 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
GTF2E1P29083 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GTF2E1P29083 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GTF2E1P29083 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GTF2E1P29083 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GTF2E1P29083 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GTF2E1P29083 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GTF2E1P29083 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GTF2E1P29083 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GTF2E1P29083 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GTF2E1P29083 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GTF2E1P29083 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GTF2E1P29083 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GTF2E1P29083 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GTF2E1P29083 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
GTF2E1P29083 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GTF2E1P29083 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GTF2E1P29083 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GTF2E1P29083 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GTF2E1P29083 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GTF2E1P29083 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GTF2E1P29083 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
GTF2E1P29083 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GTF2E1P29083 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GTF2E1P29083 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GTF2E1P29083 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GTF2E1P29083 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GTF2E1P29083 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
GTF2E1P29083 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.7 ms