Protein–RNA interactions for Protein: P28330

ACADL, Long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADLP28330 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACADLP28330 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACADLP28330 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACADLP28330 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ACADLP28330 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACADLP28330 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACADLP28330 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACADLP28330 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACADLP28330 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACADLP28330 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACADLP28330 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACADLP28330 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACADLP28330 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACADLP28330 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACADLP28330 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACADLP28330 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACADLP28330 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACADLP28330 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACADLP28330 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACADLP28330 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACADLP28330 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACADLP28330 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ACADLP28330 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACADLP28330 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACADLP28330 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACADLP28330 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ACADLP28330 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ACADLP28330 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACADLP28330 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACADLP28330 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACADLP28330 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACADLP28330 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACADLP28330 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACADLP28330 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACADLP28330 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACADLP28330 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACADLP28330 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACADLP28330 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACADLP28330 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACADLP28330 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACADLP28330 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACADLP28330 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ACADLP28330 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACADLP28330 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACADLP28330 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ACADLP28330 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACADLP28330 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACADLP28330 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACADLP28330 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACADLP28330 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACADLP28330 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACADLP28330 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACADLP28330 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACADLP28330 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ACADLP28330 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACADLP28330 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACADLP28330 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACADLP28330 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACADLP28330 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACADLP28330 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ACADLP28330 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACADLP28330 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACADLP28330 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACADLP28330 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ACADLP28330 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACADLP28330 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACADLP28330 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACADLP28330 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACADLP28330 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACADLP28330 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ACADLP28330 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACADLP28330 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACADLP28330 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACADLP28330 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACADLP28330 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ACADLP28330 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ACADLP28330 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACADLP28330 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACADLP28330 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACADLP28330 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACADLP28330 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACADLP28330 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACADLP28330 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACADLP28330 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACADLP28330 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACADLP28330 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACADLP28330 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACADLP28330 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACADLP28330 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACADLP28330 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACADLP28330 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACADLP28330 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACADLP28330 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACADLP28330 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACADLP28330 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACADLP28330 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACADLP28330 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACADLP28330 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACADLP28330 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACADLP28330 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms