Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMA1P25786 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMA1P25786 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMA1P25786 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMA1P25786 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMA1P25786 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMA1P25786 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMA1P25786 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMA1P25786 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMA1P25786 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMA1P25786 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMA1P25786 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMA1P25786 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMA1P25786 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMA1P25786 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms