Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FGFR4P22455 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGFR4P22455 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGFR4P22455 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGFR4P22455 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FGFR4P22455 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGFR4P22455 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGFR4P22455 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGFR4P22455 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGFR4P22455 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGFR4P22455 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGFR4P22455 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGFR4P22455 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGFR4P22455 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGFR4P22455 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
FGFR4P22455 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGFR4P22455 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGFR4P22455 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGFR4P22455 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGFR4P22455 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGFR4P22455 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGFR4P22455 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGFR4P22455 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms