Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SAA2P0DJI9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SAA2P0DJI9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms