Protein–RNA interactions for Protein: P04216

THY1, Thy-1 membrane glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THY1P04216 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
THY1P04216 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THY1P04216 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THY1P04216 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THY1P04216 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THY1P04216 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THY1P04216 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THY1P04216 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THY1P04216 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THY1P04216 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THY1P04216 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THY1P04216 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THY1P04216 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THY1P04216 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
THY1P04216 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THY1P04216 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THY1P04216 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THY1P04216 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THY1P04216 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THY1P04216 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THY1P04216 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
THY1P04216 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THY1P04216 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THY1P04216 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
THY1P04216 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
THY1P04216 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
THY1P04216 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
THY1P04216 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
THY1P04216 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
THY1P04216 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THY1P04216 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
THY1P04216 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THY1P04216 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
THY1P04216 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THY1P04216 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THY1P04216 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
THY1P04216 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
THY1P04216 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
THY1P04216 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
THY1P04216 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THY1P04216 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THY1P04216 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THY1P04216 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THY1P04216 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THY1P04216 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THY1P04216 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THY1P04216 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THY1P04216 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THY1P04216 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THY1P04216 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THY1P04216 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THY1P04216 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THY1P04216 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THY1P04216 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THY1P04216 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THY1P04216 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THY1P04216 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THY1P04216 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THY1P04216 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THY1P04216 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
THY1P04216 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THY1P04216 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THY1P04216 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
THY1P04216 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THY1P04216 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
THY1P04216 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
THY1P04216 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
THY1P04216 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THY1P04216 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THY1P04216 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THY1P04216 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THY1P04216 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THY1P04216 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THY1P04216 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THY1P04216 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THY1P04216 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THY1P04216 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THY1P04216 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THY1P04216 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THY1P04216 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THY1P04216 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THY1P04216 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THY1P04216 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THY1P04216 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THY1P04216 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THY1P04216 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THY1P04216 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THY1P04216 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THY1P04216 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
THY1P04216 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
THY1P04216 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
THY1P04216 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
THY1P04216 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
THY1P04216 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
THY1P04216 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
THY1P04216 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
THY1P04216 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
THY1P04216 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THY1P04216 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
THY1P04216 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms