Protein–RNA interactions for Protein: P01717

IGLV3-25, Immunoglobulin lambda variable 3-25, humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGLV3-25P01717 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGLV3-25P01717 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGLV3-25P01717 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGLV3-25P01717 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGLV3-25P01717 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
IGLV3-25P01717 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGLV3-25P01717 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGLV3-25P01717 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGLV3-25P01717 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGLV3-25P01717 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGLV3-25P01717 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IGLV3-25P01717 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGLV3-25P01717 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGLV3-25P01717 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGLV3-25P01717 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGLV3-25P01717 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IGLV3-25P01717 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGLV3-25P01717 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
IGLV3-25P01717 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGLV3-25P01717 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGLV3-25P01717 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGLV3-25P01717 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGLV3-25P01717 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGLV3-25P01717 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGLV3-25P01717 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGLV3-25P01717 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGLV3-25P01717 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGLV3-25P01717 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGLV3-25P01717 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGLV3-25P01717 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGLV3-25P01717 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGLV3-25P01717 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGLV3-25P01717 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
IGLV3-25P01717 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGLV3-25P01717 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGLV3-25P01717 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGLV3-25P01717 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGLV3-25P01717 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGLV3-25P01717 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGLV3-25P01717 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGLV3-25P01717 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGLV3-25P01717 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGLV3-25P01717 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGLV3-25P01717 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGLV3-25P01717 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGLV3-25P01717 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGLV3-25P01717 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGLV3-25P01717 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGLV3-25P01717 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGLV3-25P01717 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGLV3-25P01717 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGLV3-25P01717 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
IGLV3-25P01717 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGLV3-25P01717 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGLV3-25P01717 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGLV3-25P01717 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGLV3-25P01717 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGLV3-25P01717 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGLV3-25P01717 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGLV3-25P01717 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGLV3-25P01717 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGLV3-25P01717 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGLV3-25P01717 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGLV3-25P01717 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGLV3-25P01717 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGLV3-25P01717 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGLV3-25P01717 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IGLV3-25P01717 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IGLV3-25P01717 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
IGLV3-25P01717 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IGLV3-25P01717 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGLV3-25P01717 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGLV3-25P01717 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
IGLV3-25P01717 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGLV3-25P01717 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGLV3-25P01717 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGLV3-25P01717 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGLV3-25P01717 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGLV3-25P01717 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGLV3-25P01717 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGLV3-25P01717 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGLV3-25P01717 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGLV3-25P01717 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGLV3-25P01717 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGLV3-25P01717 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGLV3-25P01717 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGLV3-25P01717 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGLV3-25P01717 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGLV3-25P01717 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGLV3-25P01717 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGLV3-25P01717 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGLV3-25P01717 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IGLV3-25P01717 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGLV3-25P01717 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
IGLV3-25P01717 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGLV3-25P01717 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGLV3-25P01717 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGLV3-25P01717 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
IGLV3-25P01717 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGLV3-25P01717 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms