Protein–RNA interactions for Protein: P01282

VIP, VIP peptides, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPP01282 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIPP01282 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIPP01282 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIPP01282 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIPP01282 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIPP01282 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VIPP01282 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VIPP01282 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIPP01282 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIPP01282 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VIPP01282 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIPP01282 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIPP01282 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIPP01282 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIPP01282 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIPP01282 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIPP01282 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIPP01282 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VIPP01282 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIPP01282 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIPP01282 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIPP01282 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VIPP01282 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VIPP01282 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VIPP01282 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VIPP01282 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VIPP01282 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VIPP01282 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VIPP01282 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VIPP01282 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VIPP01282 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VIPP01282 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VIPP01282 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VIPP01282 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VIPP01282 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VIPP01282 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VIPP01282 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VIPP01282 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VIPP01282 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VIPP01282 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VIPP01282 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VIPP01282 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VIPP01282 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VIPP01282 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VIPP01282 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VIPP01282 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VIPP01282 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VIPP01282 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VIPP01282 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIPP01282 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIPP01282 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIPP01282 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIPP01282 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIPP01282 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIPP01282 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIPP01282 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIPP01282 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VIPP01282 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VIPP01282 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VIPP01282 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VIPP01282 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VIPP01282 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VIPP01282 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VIPP01282 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VIPP01282 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VIPP01282 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VIPP01282 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VIPP01282 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VIPP01282 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VIPP01282 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VIPP01282 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VIPP01282 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VIPP01282 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VIPP01282 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VIPP01282 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VIPP01282 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VIPP01282 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VIPP01282 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VIPP01282 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VIPP01282 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VIPP01282 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VIPP01282 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VIPP01282 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VIPP01282 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VIPP01282 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VIPP01282 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VIPP01282 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VIPP01282 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIPP01282 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIPP01282 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIPP01282 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIPP01282 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VIPP01282 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIPP01282 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIPP01282 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIPP01282 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIPP01282 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIPP01282 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIPP01282 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIPP01282 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms