Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNSO60931 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNSO60931 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNSO60931 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNSO60931 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNSO60931 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNSO60931 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNSO60931 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNSO60931 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNSO60931 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNSO60931 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNSO60931 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNSO60931 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNSO60931 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNSO60931 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNSO60931 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNSO60931 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNSO60931 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNSO60931 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNSO60931 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNSO60931 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNSO60931 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNSO60931 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNSO60931 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNSO60931 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNSO60931 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNSO60931 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNSO60931 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNSO60931 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNSO60931 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNSO60931 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNSO60931 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNSO60931 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNSO60931 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNSO60931 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNSO60931 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNSO60931 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNSO60931 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNSO60931 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNSO60931 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNSO60931 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNSO60931 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNSO60931 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNSO60931 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNSO60931 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNSO60931 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNSO60931 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNSO60931 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNSO60931 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNSO60931 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNSO60931 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNSO60931 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNSO60931 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNSO60931 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNSO60931 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNSO60931 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTNSO60931 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTNSO60931 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNSO60931 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNSO60931 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNSO60931 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNSO60931 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNSO60931 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNSO60931 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNSO60931 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNSO60931 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNSO60931 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNSO60931 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNSO60931 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNSO60931 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNSO60931 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNSO60931 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNSO60931 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNSO60931 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNSO60931 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNSO60931 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNSO60931 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNSO60931 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNSO60931 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNSO60931 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNSO60931 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNSO60931 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNSO60931 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNSO60931 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNSO60931 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNSO60931 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNSO60931 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNSO60931 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNSO60931 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNSO60931 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNSO60931 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNSO60931 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNSO60931 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNSO60931 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNSO60931 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNSO60931 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNSO60931 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNSO60931 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNSO60931 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNSO60931 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms