Protein–RNA interactions for Protein: O60383

GDF9, Growth/differentiation factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF9O60383 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF9O60383 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF9O60383 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF9O60383 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF9O60383 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF9O60383 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF9O60383 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF9O60383 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF9O60383 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF9O60383 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF9O60383 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF9O60383 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF9O60383 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF9O60383 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF9O60383 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF9O60383 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF9O60383 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF9O60383 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF9O60383 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF9O60383 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF9O60383 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF9O60383 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF9O60383 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF9O60383 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF9O60383 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF9O60383 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF9O60383 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF9O60383 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF9O60383 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF9O60383 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF9O60383 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF9O60383 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF9O60383 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF9O60383 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF9O60383 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF9O60383 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF9O60383 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF9O60383 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF9O60383 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF9O60383 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GDF9O60383 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF9O60383 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF9O60383 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF9O60383 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF9O60383 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF9O60383 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF9O60383 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF9O60383 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF9O60383 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF9O60383 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF9O60383 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF9O60383 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF9O60383 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF9O60383 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF9O60383 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF9O60383 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF9O60383 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF9O60383 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF9O60383 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF9O60383 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF9O60383 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF9O60383 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF9O60383 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF9O60383 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF9O60383 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF9O60383 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF9O60383 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF9O60383 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF9O60383 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDF9O60383 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDF9O60383 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDF9O60383 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GDF9O60383 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDF9O60383 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDF9O60383 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF9O60383 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF9O60383 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF9O60383 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF9O60383 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF9O60383 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF9O60383 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDF9O60383 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDF9O60383 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDF9O60383 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDF9O60383 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GDF9O60383 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDF9O60383 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDF9O60383 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDF9O60383 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GDF9O60383 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GDF9O60383 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF9O60383 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF9O60383 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF9O60383 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF9O60383 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF9O60383 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF9O60383 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF9O60383 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF9O60383 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF9O60383 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms