Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DHX16O60231 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DHX16O60231 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
DHX16O60231 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DHX16O60231 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DHX16O60231 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DHX16O60231 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DHX16O60231 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DHX16O60231 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DHX16O60231 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DHX16O60231 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DHX16O60231 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DHX16O60231 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DHX16O60231 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DHX16O60231 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DHX16O60231 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DHX16O60231 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DHX16O60231 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DHX16O60231 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DHX16O60231 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DHX16O60231 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DHX16O60231 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DHX16O60231 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DHX16O60231 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DHX16O60231 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DHX16O60231 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DHX16O60231 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DHX16O60231 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DHX16O60231 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DHX16O60231 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DHX16O60231 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DHX16O60231 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DHX16O60231 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
DHX16O60231 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DHX16O60231 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DHX16O60231 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DHX16O60231 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DHX16O60231 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DHX16O60231 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DHX16O60231 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DHX16O60231 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DHX16O60231 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DHX16O60231 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DHX16O60231 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
DHX16O60231 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DHX16O60231 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DHX16O60231 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DHX16O60231 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DHX16O60231 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DHX16O60231 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DHX16O60231 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DHX16O60231 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DHX16O60231 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DHX16O60231 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DHX16O60231 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX16O60231 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DHX16O60231 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
DHX16O60231 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DHX16O60231 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DHX16O60231 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DHX16O60231 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DHX16O60231 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
DHX16O60231 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.57■■■□□ 2
DHX16O60231 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DHX16O60231 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DHX16O60231 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DHX16O60231 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DHX16O60231 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DHX16O60231 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
DHX16O60231 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.56■■■□□ 2
DHX16O60231 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
DHX16O60231 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DHX16O60231 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DHX16O60231 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DHX16O60231 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
DHX16O60231 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DHX16O60231 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DHX16O60231 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DHX16O60231 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DHX16O60231 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DHX16O60231 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
DHX16O60231 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DHX16O60231 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.54■■■□□ 2
DHX16O60231 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DHX16O60231 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.53■■■□□ 2
DHX16O60231 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DHX16O60231 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
DHX16O60231 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DHX16O60231 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DHX16O60231 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DHX16O60231 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DHX16O60231 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DHX16O60231 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DHX16O60231 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DHX16O60231 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DHX16O60231 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DHX16O60231 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DHX16O60231 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DHX16O60231 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DHX16O60231 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms