Protein–RNA interactions for Protein: O60216

RAD21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD21O60216 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAD21O60216 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAD21O60216 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAD21O60216 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RAD21O60216 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAD21O60216 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAD21O60216 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RAD21O60216 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RAD21O60216 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RAD21O60216 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RAD21O60216 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RAD21O60216 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
RAD21O60216 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RAD21O60216 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAD21O60216 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAD21O60216 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RAD21O60216 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAD21O60216 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAD21O60216 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAD21O60216 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAD21O60216 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAD21O60216 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAD21O60216 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAD21O60216 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAD21O60216 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAD21O60216 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAD21O60216 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAD21O60216 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAD21O60216 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RAD21O60216 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAD21O60216 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAD21O60216 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAD21O60216 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAD21O60216 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAD21O60216 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAD21O60216 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAD21O60216 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAD21O60216 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAD21O60216 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAD21O60216 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAD21O60216 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RAD21O60216 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAD21O60216 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAD21O60216 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAD21O60216 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAD21O60216 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAD21O60216 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAD21O60216 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAD21O60216 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAD21O60216 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAD21O60216 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAD21O60216 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAD21O60216 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAD21O60216 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAD21O60216 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAD21O60216 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAD21O60216 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAD21O60216 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAD21O60216 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAD21O60216 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAD21O60216 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAD21O60216 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAD21O60216 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAD21O60216 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAD21O60216 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RAD21O60216 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAD21O60216 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAD21O60216 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAD21O60216 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAD21O60216 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAD21O60216 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAD21O60216 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAD21O60216 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAD21O60216 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAD21O60216 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAD21O60216 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAD21O60216 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAD21O60216 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RAD21O60216 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAD21O60216 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAD21O60216 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAD21O60216 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAD21O60216 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAD21O60216 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAD21O60216 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAD21O60216 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAD21O60216 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAD21O60216 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAD21O60216 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAD21O60216 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAD21O60216 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAD21O60216 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAD21O60216 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAD21O60216 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RAD21O60216 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAD21O60216 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAD21O60216 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAD21O60216 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAD21O60216 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAD21O60216 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms