Protein–RNA interactions for Protein: O43402

EMC8, ER membrane protein complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC8O43402 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMC8O43402 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMC8O43402 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMC8O43402 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMC8O43402 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMC8O43402 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMC8O43402 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMC8O43402 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMC8O43402 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMC8O43402 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMC8O43402 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EMC8O43402 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EMC8O43402 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EMC8O43402 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EMC8O43402 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EMC8O43402 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EMC8O43402 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMC8O43402 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMC8O43402 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMC8O43402 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMC8O43402 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EMC8O43402 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMC8O43402 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EMC8O43402 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EMC8O43402 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EMC8O43402 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EMC8O43402 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EMC8O43402 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EMC8O43402 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMC8O43402 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMC8O43402 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMC8O43402 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMC8O43402 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMC8O43402 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMC8O43402 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMC8O43402 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMC8O43402 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMC8O43402 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMC8O43402 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMC8O43402 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMC8O43402 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMC8O43402 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMC8O43402 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMC8O43402 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMC8O43402 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMC8O43402 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMC8O43402 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMC8O43402 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMC8O43402 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMC8O43402 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMC8O43402 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMC8O43402 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMC8O43402 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMC8O43402 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMC8O43402 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EMC8O43402 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EMC8O43402 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EMC8O43402 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EMC8O43402 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EMC8O43402 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EMC8O43402 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EMC8O43402 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EMC8O43402 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMC8O43402 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMC8O43402 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EMC8O43402 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMC8O43402 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMC8O43402 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMC8O43402 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMC8O43402 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMC8O43402 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMC8O43402 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMC8O43402 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMC8O43402 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EMC8O43402 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMC8O43402 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EMC8O43402 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMC8O43402 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMC8O43402 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMC8O43402 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMC8O43402 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMC8O43402 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMC8O43402 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMC8O43402 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMC8O43402 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EMC8O43402 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
EMC8O43402 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EMC8O43402 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EMC8O43402 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EMC8O43402 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EMC8O43402 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMC8O43402 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMC8O43402 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMC8O43402 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMC8O43402 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMC8O43402 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMC8O43402 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMC8O43402 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EMC8O43402 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMC8O43402 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms