Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP290O15078 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP290O15078 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP290O15078 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP290O15078 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP290O15078 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP290O15078 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP290O15078 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP290O15078 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP290O15078 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP290O15078 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP290O15078 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP290O15078 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP290O15078 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP290O15078 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP290O15078 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP290O15078 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP290O15078 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP290O15078 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP290O15078 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP290O15078 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP290O15078 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP290O15078 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP290O15078 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP290O15078 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP290O15078 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CEP290O15078 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CEP290O15078 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP290O15078 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP290O15078 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP290O15078 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP290O15078 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP290O15078 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP290O15078 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CEP290O15078 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CEP290O15078 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CEP290O15078 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CEP290O15078 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CEP290O15078 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CEP290O15078 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CEP290O15078 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP290O15078 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP290O15078 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP290O15078 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CEP290O15078 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
CEP290O15078 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CEP290O15078 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CEP290O15078 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CEP290O15078 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CEP290O15078 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CEP290O15078 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CEP290O15078 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CEP290O15078 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP290O15078 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP290O15078 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP290O15078 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP290O15078 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP290O15078 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP290O15078 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP290O15078 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP290O15078 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP290O15078 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP290O15078 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP290O15078 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP290O15078 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP290O15078 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP290O15078 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP290O15078 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP290O15078 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP290O15078 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP290O15078 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP290O15078 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP290O15078 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP290O15078 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP290O15078 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP290O15078 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP290O15078 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP290O15078 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP290O15078 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP290O15078 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP290O15078 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP290O15078 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP290O15078 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP290O15078 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP290O15078 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP290O15078 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CEP290O15078 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CEP290O15078 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CEP290O15078 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CEP290O15078 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CEP290O15078 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP290O15078 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP290O15078 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP290O15078 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP290O15078 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP290O15078 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP290O15078 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP290O15078 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP290O15078 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP290O15078 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.2 ms