Protein–RNA interactions for Protein: O15049

N4BP3, NEDD4-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3O15049 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
N4BP3O15049 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
N4BP3O15049 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
N4BP3O15049 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
N4BP3O15049 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
N4BP3O15049 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
N4BP3O15049 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
N4BP3O15049 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
N4BP3O15049 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
N4BP3O15049 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
N4BP3O15049 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
N4BP3O15049 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
N4BP3O15049 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
N4BP3O15049 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
N4BP3O15049 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
N4BP3O15049 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
N4BP3O15049 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
N4BP3O15049 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
N4BP3O15049 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
N4BP3O15049 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
N4BP3O15049 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
N4BP3O15049 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
N4BP3O15049 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
N4BP3O15049 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
N4BP3O15049 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
N4BP3O15049 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
N4BP3O15049 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
N4BP3O15049 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
N4BP3O15049 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
N4BP3O15049 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
N4BP3O15049 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
N4BP3O15049 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
N4BP3O15049 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
N4BP3O15049 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms