Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NPIPA5E9PKD4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.7 ms