Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PALM3A6NDB9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PALM3A6NDB9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PALM3A6NDB9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PALM3A6NDB9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PALM3A6NDB9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PALM3A6NDB9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PALM3A6NDB9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PALM3A6NDB9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PALM3A6NDB9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PALM3A6NDB9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PALM3A6NDB9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PALM3A6NDB9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PALM3A6NDB9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PALM3A6NDB9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PALM3A6NDB9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PALM3A6NDB9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PALM3A6NDB9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PALM3A6NDB9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PALM3A6NDB9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PALM3A6NDB9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PALM3A6NDB9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms