Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X0B3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X0B3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
A0A087X0B3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
A0A087X0B3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
A0A087X0B3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
A0A087X0B3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
A0A087X0B3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
A0A087X0B3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
A0A087X0B3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
A0A087X0B3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
A0A087X0B3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
A0A087X0B3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
A0A087X0B3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
A0A087X0B3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
A0A087X0B3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
A0A087X0B3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
A0A087X0B3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms