Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC97Q96F63 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC97Q96F63 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC97Q96F63 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC97Q96F63 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC97Q96F63 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC97Q96F63 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC97Q96F63 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC97Q96F63 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC97Q96F63 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC97Q96F63 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC97Q96F63 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC97Q96F63 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC97Q96F63 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC97Q96F63 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC97Q96F63 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC97Q96F63 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC97Q96F63 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC97Q96F63 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC97Q96F63 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC97Q96F63 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC97Q96F63 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC97Q96F63 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC97Q96F63 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC97Q96F63 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC97Q96F63 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC97Q96F63 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC97Q96F63 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC97Q96F63 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC97Q96F63 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC97Q96F63 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC97Q96F63 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC97Q96F63 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC97Q96F63 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC97Q96F63 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC97Q96F63 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC97Q96F63 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC97Q96F63 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC97Q96F63 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC97Q96F63 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC97Q96F63 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC97Q96F63 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC97Q96F63 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC97Q96F63 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC97Q96F63 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC97Q96F63 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC97Q96F63 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC97Q96F63 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC97Q96F63 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC97Q96F63 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC97Q96F63 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC97Q96F63 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC97Q96F63 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC97Q96F63 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC97Q96F63 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC97Q96F63 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC97Q96F63 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC97Q96F63 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC97Q96F63 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC97Q96F63 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC97Q96F63 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC97Q96F63 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC97Q96F63 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC97Q96F63 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC97Q96F63 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC97Q96F63 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC97Q96F63 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC97Q96F63 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC97Q96F63 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC97Q96F63 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC97Q96F63 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC97Q96F63 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC97Q96F63 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC97Q96F63 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC97Q96F63 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC97Q96F63 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC97Q96F63 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC97Q96F63 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC97Q96F63 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC97Q96F63 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC97Q96F63 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC97Q96F63 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC97Q96F63 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC97Q96F63 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC97Q96F63 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC97Q96F63 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC97Q96F63 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC97Q96F63 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC97Q96F63 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC97Q96F63 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC97Q96F63 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC97Q96F63 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC97Q96F63 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC97Q96F63 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC97Q96F63 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC97Q96F63 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC97Q96F63 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC97Q96F63 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC97Q96F63 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC97Q96F63 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms