Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TTC9Q92623 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TTC9Q92623 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TTC9Q92623 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC9Q92623 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTC9Q92623 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTC9Q92623 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC9Q92623 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC9Q92623 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC9Q92623 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC9Q92623 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC9Q92623 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTC9Q92623 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC9Q92623 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC9Q92623 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC9Q92623 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC9Q92623 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTC9Q92623 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTC9Q92623 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TTC9Q92623 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TTC9Q92623 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TTC9Q92623 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TTC9Q92623 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTC9Q92623 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTC9Q92623 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TTC9Q92623 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTC9Q92623 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTC9Q92623 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TTC9Q92623 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTC9Q92623 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC9Q92623 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC9Q92623 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC9Q92623 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTC9Q92623 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TTC9Q92623 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TTC9Q92623 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC9Q92623 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC9Q92623 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC9Q92623 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC9Q92623 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TTC9Q92623 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC9Q92623 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC9Q92623 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC9Q92623 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC9Q92623 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC9Q92623 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC9Q92623 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC9Q92623 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC9Q92623 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC9Q92623 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC9Q92623 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC9Q92623 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC9Q92623 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC9Q92623 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTC9Q92623 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC9Q92623 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC9Q92623 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC9Q92623 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC9Q92623 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTC9Q92623 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTC9Q92623 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTC9Q92623 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTC9Q92623 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC9Q92623 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC9Q92623 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC9Q92623 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC9Q92623 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC9Q92623 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC9Q92623 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC9Q92623 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC9Q92623 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTC9Q92623 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTC9Q92623 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC9Q92623 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC9Q92623 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC9Q92623 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC9Q92623 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC9Q92623 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC9Q92623 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC9Q92623 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC9Q92623 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC9Q92623 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC9Q92623 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC9Q92623 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC9Q92623 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC9Q92623 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC9Q92623 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTC9Q92623 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTC9Q92623 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTC9Q92623 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTC9Q92623 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTC9Q92623 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTC9Q92623 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTC9Q92623 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TTC9Q92623 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTC9Q92623 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTC9Q92623 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TTC9Q92623 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTC9Q92623 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTC9Q92623 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms