Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHF3Q92576 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHF3Q92576 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PHF3Q92576 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHF3Q92576 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PHF3Q92576 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHF3Q92576 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHF3Q92576 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHF3Q92576 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHF3Q92576 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHF3Q92576 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHF3Q92576 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHF3Q92576 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHF3Q92576 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHF3Q92576 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHF3Q92576 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHF3Q92576 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHF3Q92576 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHF3Q92576 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHF3Q92576 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHF3Q92576 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHF3Q92576 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHF3Q92576 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHF3Q92576 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHF3Q92576 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHF3Q92576 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHF3Q92576 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PHF3Q92576 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHF3Q92576 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHF3Q92576 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHF3Q92576 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHF3Q92576 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHF3Q92576 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHF3Q92576 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHF3Q92576 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHF3Q92576 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHF3Q92576 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHF3Q92576 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHF3Q92576 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHF3Q92576 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHF3Q92576 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHF3Q92576 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHF3Q92576 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHF3Q92576 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PHF3Q92576 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PHF3Q92576 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHF3Q92576 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF3Q92576 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF3Q92576 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF3Q92576 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHF3Q92576 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHF3Q92576 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PHF3Q92576 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHF3Q92576 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHF3Q92576 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PHF3Q92576 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHF3Q92576 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHF3Q92576 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHF3Q92576 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHF3Q92576 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHF3Q92576 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHF3Q92576 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHF3Q92576 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHF3Q92576 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHF3Q92576 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHF3Q92576 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHF3Q92576 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHF3Q92576 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHF3Q92576 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHF3Q92576 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHF3Q92576 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHF3Q92576 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PHF3Q92576 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHF3Q92576 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHF3Q92576 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF3Q92576 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF3Q92576 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF3Q92576 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF3Q92576 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHF3Q92576 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF3Q92576 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF3Q92576 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF3Q92576 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF3Q92576 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF3Q92576 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF3Q92576 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF3Q92576 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF3Q92576 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF3Q92576 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF3Q92576 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF3Q92576 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF3Q92576 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF3Q92576 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF3Q92576 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF3Q92576 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF3Q92576 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF3Q92576 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF3Q92576 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF3Q92576 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF3Q92576 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms