Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOBEC4Q8WW27 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOBEC4Q8WW27 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOBEC4Q8WW27 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APOBEC4Q8WW27 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
APOBEC4Q8WW27 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOBEC4Q8WW27 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOBEC4Q8WW27 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOBEC4Q8WW27 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOBEC4Q8WW27 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
APOBEC4Q8WW27 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
APOBEC4Q8WW27 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
APOBEC4Q8WW27 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APOBEC4Q8WW27 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
APOBEC4Q8WW27 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
APOBEC4Q8WW27 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
APOBEC4Q8WW27 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
APOBEC4Q8WW27 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
APOBEC4Q8WW27 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
APOBEC4Q8WW27 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
APOBEC4Q8WW27 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
APOBEC4Q8WW27 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
APOBEC4Q8WW27 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
APOBEC4Q8WW27 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
APOBEC4Q8WW27 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
APOBEC4Q8WW27 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
APOBEC4Q8WW27 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
APOBEC4Q8WW27 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
APOBEC4Q8WW27 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
APOBEC4Q8WW27 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
APOBEC4Q8WW27 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
APOBEC4Q8WW27 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
APOBEC4Q8WW27 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
APOBEC4Q8WW27 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
APOBEC4Q8WW27 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
APOBEC4Q8WW27 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APOBEC4Q8WW27 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APOBEC4Q8WW27 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APOBEC4Q8WW27 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
APOBEC4Q8WW27 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APOBEC4Q8WW27 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
APOBEC4Q8WW27 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APOBEC4Q8WW27 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
APOBEC4Q8WW27 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
APOBEC4Q8WW27 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOBEC4Q8WW27 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
APOBEC4Q8WW27 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
APOBEC4Q8WW27 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
APOBEC4Q8WW27 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
APOBEC4Q8WW27 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
APOBEC4Q8WW27 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
APOBEC4Q8WW27 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APOBEC4Q8WW27 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOBEC4Q8WW27 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOBEC4Q8WW27 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOBEC4Q8WW27 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APOBEC4Q8WW27 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APOBEC4Q8WW27 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOBEC4Q8WW27 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOBEC4Q8WW27 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOBEC4Q8WW27 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
APOBEC4Q8WW27 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
APOBEC4Q8WW27 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
APOBEC4Q8WW27 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APOBEC4Q8WW27 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
APOBEC4Q8WW27 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
APOBEC4Q8WW27 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
APOBEC4Q8WW27 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOBEC4Q8WW27 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOBEC4Q8WW27 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOBEC4Q8WW27 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
APOBEC4Q8WW27 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOBEC4Q8WW27 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOBEC4Q8WW27 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
APOBEC4Q8WW27 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOBEC4Q8WW27 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOBEC4Q8WW27 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
APOBEC4Q8WW27 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOBEC4Q8WW27 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOBEC4Q8WW27 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBEC4Q8WW27 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBEC4Q8WW27 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBEC4Q8WW27 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOBEC4Q8WW27 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOBEC4Q8WW27 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBEC4Q8WW27 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBEC4Q8WW27 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBEC4Q8WW27 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBEC4Q8WW27 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOBEC4Q8WW27 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOBEC4Q8WW27 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOBEC4Q8WW27 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOBEC4Q8WW27 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOBEC4Q8WW27 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBEC4Q8WW27 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOBEC4Q8WW27 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
APOBEC4Q8WW27 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
APOBEC4Q8WW27 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
APOBEC4Q8WW27 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOBEC4Q8WW27 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms