Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SVIPQ8NHG7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SVIPQ8NHG7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SVIPQ8NHG7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SVIPQ8NHG7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SVIPQ8NHG7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SVIPQ8NHG7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SVIPQ8NHG7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SVIPQ8NHG7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SVIPQ8NHG7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SVIPQ8NHG7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SVIPQ8NHG7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SVIPQ8NHG7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SVIPQ8NHG7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SVIPQ8NHG7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SVIPQ8NHG7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SVIPQ8NHG7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SVIPQ8NHG7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SVIPQ8NHG7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVIPQ8NHG7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SVIPQ8NHG7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SVIPQ8NHG7 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SVIPQ8NHG7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SVIPQ8NHG7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SVIPQ8NHG7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SVIPQ8NHG7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SVIPQ8NHG7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SVIPQ8NHG7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SVIPQ8NHG7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SVIPQ8NHG7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SVIPQ8NHG7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SVIPQ8NHG7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SVIPQ8NHG7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SVIPQ8NHG7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SVIPQ8NHG7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SVIPQ8NHG7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SVIPQ8NHG7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SVIPQ8NHG7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SVIPQ8NHG7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SVIPQ8NHG7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SVIPQ8NHG7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SVIPQ8NHG7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SVIPQ8NHG7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SVIPQ8NHG7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SVIPQ8NHG7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SVIPQ8NHG7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SVIPQ8NHG7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SVIPQ8NHG7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SVIPQ8NHG7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SVIPQ8NHG7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SVIPQ8NHG7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SVIPQ8NHG7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SVIPQ8NHG7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SVIPQ8NHG7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SVIPQ8NHG7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SVIPQ8NHG7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SVIPQ8NHG7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SVIPQ8NHG7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SVIPQ8NHG7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SVIPQ8NHG7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SVIPQ8NHG7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SVIPQ8NHG7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SVIPQ8NHG7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SVIPQ8NHG7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SVIPQ8NHG7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVIPQ8NHG7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SVIPQ8NHG7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SVIPQ8NHG7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SVIPQ8NHG7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVIPQ8NHG7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVIPQ8NHG7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVIPQ8NHG7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVIPQ8NHG7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SVIPQ8NHG7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SVIPQ8NHG7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SVIPQ8NHG7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVIPQ8NHG7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVIPQ8NHG7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVIPQ8NHG7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVIPQ8NHG7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SVIPQ8NHG7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SVIPQ8NHG7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SVIPQ8NHG7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SVIPQ8NHG7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SVIPQ8NHG7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SVIPQ8NHG7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SVIPQ8NHG7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SVIPQ8NHG7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVIPQ8NHG7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVIPQ8NHG7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVIPQ8NHG7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVIPQ8NHG7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SVIPQ8NHG7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SVIPQ8NHG7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVIPQ8NHG7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVIPQ8NHG7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVIPQ8NHG7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVIPQ8NHG7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVIPQ8NHG7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVIPQ8NHG7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms