Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 SPCS1-202ENST00000423431 822 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.632e-11■■■■■ 114.2
PABPC4Q13310 VEGFA-211ENST00000476772 1683 ntTSL 1 (best)32.66■■■□□ 2.826e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.666e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.666e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.566e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.536e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-220ENST00000519767 970 ntTSL 1 (best)30.83■■■□□ 2.536e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.486e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.486e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.486e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.486e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.486e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.486e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.486e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.486e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.26e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-217ENST00000518538 535 ntTSL 226.13■■□□□ 1.776e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.046e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-221ENST00000520265 336 ntTSL 517■□□□□ 0.316e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.26e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.136e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-224ENST00000523873 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.016e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-210ENST00000457104 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.016e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-218ENST00000518689 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.016e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-223ENST00000523125 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.016e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-225ENST00000523950 954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.016e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 AC127070.1-201ENST00000488441 484 ntBASIC12.85□□□□□ -0.356e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-214ENST00000493786 551 ntTSL 28.92□□□□□ -0.986e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.266e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.476e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.686e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC18.23■□□□□ 0.511e-323■■■■■ 111.4
PABPC4Q13310 ZNF581-204ENST00000588537 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.189e-17■■■■■ 108.3
PABPC4Q13310 ZNF581-201ENST00000270451 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.189e-17■■■■■ 108.3
PABPC4Q13310 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.255e-13■■■■■ 106.8
PABPC4Q13310 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.125e-13■■■■■ 106.8
PABPC4Q13310 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.515e-13■■■■■ 106.8
PABPC4Q13310 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.32e-9■■■■■ 106.1
PABPC4Q13310 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.772e-9■■■■■ 106.1
PABPC4Q13310 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.789e-33■■■■■ 105.6
PABPC4Q13310 FAM238C-202ENST00000639963 1787 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.069e-33■■■■■ 105.6
PABPC4Q13310 FAM238C-201ENST00000638416 868 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.29e-33■■■■■ 105.6
PABPC4Q13310 FAM238C-203ENST00000640121 3620 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.539e-33■■■■■ 105.6
PABPC4Q13310 FAM238C-205ENST00000640641 391 ntBASIC10.64□□□□□ -0.719e-33■■■■■ 105.6
PABPC4Q13310 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.675e-12■■■■■ 104.3
PABPC4Q13310 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.345e-12■■■■■ 104.3
PABPC4Q13310 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.275e-12■■■■■ 104.3
PABPC4Q13310 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.245e-12■■■■■ 104.3
PABPC4Q13310 EGR2-206ENST00000639815 1075 ntTSL 515.84■□□□□ 0.135e-12■■■■■ 104.3
PABPC4Q13310 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.045e-12■■■■■ 104.3
PABPC4Q13310 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -05e-12■■■■■ 104.3
PABPC4Q13310 MLF1-202ENST00000359117 2222 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.645e-12■■■■■ 104.3
PABPC4Q13310 MLF1-214ENST00000497004 3048 ntTSL 1 (best)9.42□□□□□ -0.95e-12■■■■■ 104.3
PABPC4Q13310 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.855e-12■■■■■ 104.3
PABPC4Q13310 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.363e-24■■■■■ 103
PABPC4Q13310 C1D-202ENST00000407324 1379 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.122e-10■■■■■ 102
PABPC4Q13310 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.552e-10■■■■■ 102
PABPC4Q13310 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.676e-25■■■■■ 101.7
PABPC4Q13310 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.586e-25■■■■■ 101.7
PABPC4Q13310 ZNF749-202ENST00000415248 568 ntTSL 418.62■□□□□ 0.572e-12■■■■■ 101.5
PABPC4Q13310 ZNF749-203ENST00000597296 677 ntTSL 217.73■□□□□ 0.432e-12■■■■■ 101.5
PABPC4Q13310 ZNF749-204ENST00000600697 459 ntTSL 315.41■□□□□ 0.062e-12■■■■■ 101.5
PABPC4Q13310 ZNF749-201ENST00000334181 2587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.182e-12■■■■■ 101.5
PABPC4Q13310 AC003002.3-201ENST00000597410 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.742e-12■■■■■ 101.5
PABPC4Q13310 AC010343.1-201ENST00000467270 629 ntBASIC13.49□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 99.2
PABPC4Q13310 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.63e-14■■■■■ 97.2
PABPC4Q13310 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.333e-14■■■■■ 97.2
PABPC4Q13310 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.663e-14■■■■■ 97.2
PABPC4Q13310 UNC119-205ENST00000484980 4189 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.673e-14■■■■■ 97.2
PABPC4Q13310 AP001931.1-201ENST00000531074 580 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.311e-323■■■■■ 97.2
PABPC4Q13310 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.794e-89■■■■■ 97
PABPC4Q13310 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.164e-89■■■■■ 97
PABPC4Q13310 DAD1-204ENST00000538631 441 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.494e-89■■■■■ 97
PABPC4Q13310 DAD1-203ENST00000535847 591 ntTSL 210.93□□□□□ -0.664e-89■■■■■ 97
PABPC4Q13310 DAD1-202ENST00000489532 339 ntTSL 33.56□□□□□ -1.844e-89■■■■■ 97
PABPC4Q13310 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.114e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 SELENOP-211ENST00000513303 714 ntTSL 215.17■□□□□ 0.024e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 STAT1-205ENST00000415035 663 ntTSL 314.55□□□□□ -0.084e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 C10orf90-208ENST00000488181 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 214.42□□□□□ -0.14e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 STAT1-201ENST00000361099 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.144e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 SELENOP-208ENST00000510965 787 ntTSL 513.67□□□□□ -0.224e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 SELENOP-201ENST00000505309 573 ntTSL 213.67□□□□□ -0.224e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 PRKACB-206ENST00000370689 4513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.294e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 STAT1-212ENST00000540176 4216 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.364e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 SELENOP-215ENST00000515626 566 ntTSL 412.56□□□□□ -0.44e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 SELENOP-214ENST00000514985 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.454e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 SELENOP-206ENST00000509276 738 ntTSL 511.73□□□□□ -0.534e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 SELENOP-202ENST00000506078 799 ntTSL 211.16□□□□□ -0.624e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 ADAM9-201ENST00000379917 3836 ntTSL 1 (best)10.81□□□□□ -0.684e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 ADAM9-209ENST00000487273 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.694e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 ADAM9-207ENST00000481873 3793 ntTSL 1 (best)10.28□□□□□ -0.764e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 SELENOP-204ENST00000507920 786 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.784e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 ADAM9-204ENST00000468065 3755 ntTSL 1 (best)10.01□□□□□ -0.814e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 SELENOP-209ENST00000511224 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.864e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 SELENOP-212ENST00000514218 1047 ntTSL 59.1□□□□□ -0.954e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 SELENOP-203ENST00000506577 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.024e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 PRKACB-211ENST00000432111 662 ntTSL 57.81□□□□□ -1.164e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 PRKACB-210ENST00000417530 686 ntTSL 27.81□□□□□ -1.164e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 SELENOP-210ENST00000512980 4175 ntTSL 27.53□□□□□ -1.24e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 PRKACB-216ENST00000470673 752 ntTSL 37.06□□□□□ -1.284e-11■■■■■ 96.3
Retrieved 100 of 23,669 protein–RNA pairs in 405.1 ms