RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618075.4

MLF1-216, Transcript of myeloid leukemia factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene MLF1, Length 2,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLF1-216ENST00000618075 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.55■■■■□ 3.12
MLF1-216ENST00000618075 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.94■■■□□ 2.38
MLF1-216ENST00000618075 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
MLF1-216ENST00000618075 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.69■■■□□ 2.18
MLF1-216ENST00000618075 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.52■■■□□ 2.16
MLF1-216ENST00000618075 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.44■■■□□ 2.14
MLF1-216ENST00000618075 ABCC9O60706 1549 aa28.42■■■□□ 2.14
MLF1-216ENST00000618075 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.01■■■□□ 2.07
MLF1-216ENST00000618075 NACADO15069 1562 aa27.88■■■□□ 2.05
MLF1-216ENST00000618075 SCRIBQ14160 1630 aa27.76■■■□□ 2.03
MLF1-216ENST00000618075 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.62■■■□□ 2.01
MLF1-216ENST00000618075 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
MLF1-216ENST00000618075 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.23■■□□□ 1.95
MLF1-216ENST00000618075 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.97■■□□□ 1.91
MLF1-216ENST00000618075 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.91■■□□□ 1.9
MLF1-216ENST00000618075 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
MLF1-216ENST00000618075 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.91■■□□□ 1.9
MLF1-216ENST00000618075 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.79■■□□□ 1.88
MLF1-216ENST00000618075 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
MLF1-216ENST00000618075 WIZO95785 1651 aa26.6■■□□□ 1.85
MLF1-216ENST00000618075 SMARCA4P51532 1647 aa26.54■■□□□ 1.84
MLF1-216ENST00000618075 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.32■■□□□ 1.8
MLF1-216ENST00000618075 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
MLF1-216ENST00000618075 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.13■■□□□ 1.77
MLF1-216ENST00000618075 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.08■■□□□ 1.77
MLF1-216ENST00000618075 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
MLF1-216ENST00000618075 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.02■■□□□ 1.76
MLF1-216ENST00000618075 SMARCA2P51531 1590 aa26.01■■□□□ 1.76
MLF1-216ENST00000618075 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
MLF1-216ENST00000618075 NCAPD3P42695 1498 aa25.77■■□□□ 1.72
MLF1-216ENST00000618075 TRIM41Q8WV44 630 aa25.72■■□□□ 1.71
MLF1-216ENST00000618075 HMGXB3Q12766 1538 aa25.71■■□□□ 1.71
MLF1-216ENST00000618075 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.67■■□□□ 1.7
MLF1-216ENST00000618075 ABCC8Q09428 1581 aa25.59■■□□□ 1.69
MLF1-216ENST00000618075 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.44■■□□□ 1.66
MLF1-216ENST00000618075 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
MLF1-216ENST00000618075 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.29■■□□□ 1.64
MLF1-216ENST00000618075 CFTRP13569 1480 aa25.27■■□□□ 1.64
MLF1-216ENST00000618075 SYNJ1O43426 1573 aa25.25■■□□□ 1.63
MLF1-216ENST00000618075 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.22■■□□□ 1.63
MLF1-216ENST00000618075 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.16■■□□□ 1.62
MLF1-216ENST00000618075 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.15■■□□□ 1.62
MLF1-216ENST00000618075 SOGA1O94964 1423 aa25.13■■□□□ 1.61
MLF1-216ENST00000618075 PRDM2Q13029 1718 aa25.1■■□□□ 1.61
MLF1-216ENST00000618075 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.08■■□□□ 1.61
MLF1-216ENST00000618075 TOP2BQ02880 1626 aa25.04■■□□□ 1.6
MLF1-216ENST00000618075 NESP48681 1621 aa25.04■■□□□ 1.6
MLF1-216ENST00000618075 CUX1P39880 1505 aa25.02■■□□□ 1.6
MLF1-216ENST00000618075 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25■■□□□ 1.59
MLF1-216ENST00000618075 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.91■■□□□ 1.58
MLF1-216ENST00000618075 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.88■■□□□ 1.57
MLF1-216ENST00000618075 EEA1Q15075 1411 aa24.87■■□□□ 1.57
MLF1-216ENST00000618075 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.84■■□□□ 1.57
MLF1-216ENST00000618075 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.7■■□□□ 1.55
MLF1-216ENST00000618075 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.69■■□□□ 1.54
MLF1-216ENST00000618075 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.67■■□□□ 1.54
MLF1-216ENST00000618075 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.66■■□□□ 1.54
MLF1-216ENST00000618075 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.65■■□□□ 1.54
MLF1-216ENST00000618075 TOPBP1Q92547 1522 aa24.65■■□□□ 1.54
MLF1-216ENST00000618075 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
MLF1-216ENST00000618075 GOLGA3Q08378 1498 aa24.63■■□□□ 1.53
MLF1-216ENST00000618075 KIF21BO75037 1637 aa24.62■■□□□ 1.53
MLF1-216ENST00000618075 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
MLF1-216ENST00000618075 KIF27Q86VH2 1401 aa24.59■■□□□ 1.53
MLF1-216ENST00000618075 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.59■■□□□ 1.53
MLF1-216ENST00000618075 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.58■■□□□ 1.53
MLF1-216ENST00000618075 CUX2O14529 1486 aa24.57■■□□□ 1.52
MLF1-216ENST00000618075 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
MLF1-216ENST00000618075 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.56■■□□□ 1.52
MLF1-216ENST00000618075 CEP162Q5TB80 1403 aa24.53■■□□□ 1.52
MLF1-216ENST00000618075 PRXQ9BXM0 1461 aa24.5■■□□□ 1.51
MLF1-216ENST00000618075 IGF1RP08069 1367 aa24.45■■□□□ 1.5
MLF1-216ENST00000618075 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.42■■□□□ 1.5
MLF1-216ENST00000618075 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.4■■□□□ 1.5
MLF1-216ENST00000618075 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.37■■□□□ 1.49
MLF1-216ENST00000618075 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.36■■□□□ 1.49
MLF1-216ENST00000618075 WDR97A6NE52 1622 aa24.35■■□□□ 1.49
MLF1-216ENST00000618075 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
MLF1-216ENST00000618075 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
MLF1-216ENST00000618075 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.3■■□□□ 1.48
MLF1-216ENST00000618075 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
MLF1-216ENST00000618075 CLIP1P30622 1438 aa24.29■■□□□ 1.48
MLF1-216ENST00000618075 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
MLF1-216ENST00000618075 ERCC6Q03468 1493 aa24.27■■□□□ 1.48
MLF1-216ENST00000618075 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.23■■□□□ 1.47
MLF1-216ENST00000618075 WDR62O43379 1518 aa24.22■■□□□ 1.47
MLF1-216ENST00000618075 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
MLF1-216ENST00000618075 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.19■■□□□ 1.46
MLF1-216ENST00000618075 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
MLF1-216ENST00000618075 CUL7Q14999 1698 aa24.13■■□□□ 1.45
MLF1-216ENST00000618075 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.12■■□□□ 1.45
MLF1-216ENST00000618075 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
MLF1-216ENST00000618075 ARAP1Q96P48 1450 aa24.07■■□□□ 1.44
MLF1-216ENST00000618075 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
MLF1-216ENST00000618075 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.07■■□□□ 1.44
MLF1-216ENST00000618075 IFT140Q96RY7 1462 aa24.07■■□□□ 1.44
MLF1-216ENST00000618075 PBRM1Q86U86 1689 aa24.05■■□□□ 1.44
MLF1-216ENST00000618075 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.03■■□□□ 1.44
MLF1-216ENST00000618075 GRIN2BQ13224 1484 aa23.94■■□□□ 1.42
MLF1-216ENST00000618075 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.6 ms