Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PDE4CQ08493 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PDE4CQ08493 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PDE4CQ08493 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PDE4CQ08493 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PDE4CQ08493 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PDE4CQ08493 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PDE4CQ08493 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PDE4CQ08493 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PDE4CQ08493 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PDE4CQ08493 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PDE4CQ08493 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PDE4CQ08493 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PDE4CQ08493 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PDE4CQ08493 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PDE4CQ08493 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PDE4CQ08493 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PDE4CQ08493 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PDE4CQ08493 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PDE4CQ08493 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
PDE4CQ08493 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PDE4CQ08493 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PDE4CQ08493 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PDE4CQ08493 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PDE4CQ08493 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PDE4CQ08493 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PDE4CQ08493 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PDE4CQ08493 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PDE4CQ08493 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PDE4CQ08493 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDE4CQ08493 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PDE4CQ08493 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PDE4CQ08493 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PDE4CQ08493 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PDE4CQ08493 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PDE4CQ08493 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDE4CQ08493 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PDE4CQ08493 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PDE4CQ08493 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PDE4CQ08493 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
PDE4CQ08493 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PDE4CQ08493 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PDE4CQ08493 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PDE4CQ08493 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PDE4CQ08493 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PDE4CQ08493 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PDE4CQ08493 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PDE4CQ08493 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PDE4CQ08493 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PDE4CQ08493 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PDE4CQ08493 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PDE4CQ08493 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PDE4CQ08493 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PDE4CQ08493 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PDE4CQ08493 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PDE4CQ08493 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
PDE4CQ08493 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PDE4CQ08493 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PDE4CQ08493 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PDE4CQ08493 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PDE4CQ08493 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PDE4CQ08493 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PDE4CQ08493 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PDE4CQ08493 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PDE4CQ08493 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PDE4CQ08493 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PDE4CQ08493 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PDE4CQ08493 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PDE4CQ08493 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PDE4CQ08493 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDE4CQ08493 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDE4CQ08493 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PDE4CQ08493 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PDE4CQ08493 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PDE4CQ08493 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PDE4CQ08493 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PDE4CQ08493 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PDE4CQ08493 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PDE4CQ08493 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PDE4CQ08493 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PDE4CQ08493 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PDE4CQ08493 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PDE4CQ08493 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PDE4CQ08493 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PDE4CQ08493 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PDE4CQ08493 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PDE4CQ08493 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PDE4CQ08493 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PDE4CQ08493 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PDE4CQ08493 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PDE4CQ08493 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PDE4CQ08493 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDE4CQ08493 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDE4CQ08493 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDE4CQ08493 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDE4CQ08493 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDE4CQ08493 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDE4CQ08493 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDE4CQ08493 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PDE4CQ08493 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms