Protein–RNA interactions for Protein: O43149

ZZEF1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZZEF1O43149 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ZZEF1O43149 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZZEF1O43149 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZZEF1O43149 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ZZEF1O43149 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ZZEF1O43149 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZZEF1O43149 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZZEF1O43149 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZZEF1O43149 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZZEF1O43149 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZZEF1O43149 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZZEF1O43149 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZZEF1O43149 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZZEF1O43149 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZZEF1O43149 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZZEF1O43149 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZZEF1O43149 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZZEF1O43149 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZZEF1O43149 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZZEF1O43149 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZZEF1O43149 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ZZEF1O43149 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZZEF1O43149 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZZEF1O43149 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZZEF1O43149 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZZEF1O43149 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZZEF1O43149 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZZEF1O43149 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZZEF1O43149 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZZEF1O43149 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZZEF1O43149 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ZZEF1O43149 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZZEF1O43149 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZZEF1O43149 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZZEF1O43149 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZZEF1O43149 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZZEF1O43149 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZZEF1O43149 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZZEF1O43149 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZZEF1O43149 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZZEF1O43149 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ZZEF1O43149 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZZEF1O43149 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ZZEF1O43149 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZZEF1O43149 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZZEF1O43149 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ZZEF1O43149 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZZEF1O43149 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZZEF1O43149 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZZEF1O43149 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZZEF1O43149 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZZEF1O43149 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZZEF1O43149 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
ZZEF1O43149 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZZEF1O43149 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZZEF1O43149 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZZEF1O43149 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZZEF1O43149 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZZEF1O43149 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ZZEF1O43149 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZZEF1O43149 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZZEF1O43149 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZZEF1O43149 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZZEF1O43149 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZZEF1O43149 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ZZEF1O43149 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZZEF1O43149 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZZEF1O43149 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZZEF1O43149 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZZEF1O43149 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZZEF1O43149 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZZEF1O43149 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZZEF1O43149 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZZEF1O43149 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZZEF1O43149 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZZEF1O43149 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZZEF1O43149 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZZEF1O43149 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ZZEF1O43149 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZZEF1O43149 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZZEF1O43149 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZZEF1O43149 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZZEF1O43149 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZZEF1O43149 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZZEF1O43149 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ZZEF1O43149 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZZEF1O43149 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZZEF1O43149 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZZEF1O43149 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZZEF1O43149 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZZEF1O43149 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZZEF1O43149 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZZEF1O43149 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZZEF1O43149 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZZEF1O43149 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ZZEF1O43149 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZZEF1O43149 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZZEF1O43149 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZZEF1O43149 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZZEF1O43149 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms