Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAPN7Q9Y6W3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAPN7Q9Y6W3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms