Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FARSAQ9Y285 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FARSAQ9Y285 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 211.4 ms