Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOD1Q9Y239 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOD1Q9Y239 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOD1Q9Y239 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOD1Q9Y239 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOD1Q9Y239 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOD1Q9Y239 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOD1Q9Y239 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOD1Q9Y239 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOD1Q9Y239 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOD1Q9Y239 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOD1Q9Y239 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOD1Q9Y239 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOD1Q9Y239 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOD1Q9Y239 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOD1Q9Y239 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOD1Q9Y239 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOD1Q9Y239 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOD1Q9Y239 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOD1Q9Y239 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NOD1Q9Y239 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOD1Q9Y239 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOD1Q9Y239 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOD1Q9Y239 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOD1Q9Y239 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NOD1Q9Y239 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NOD1Q9Y239 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NOD1Q9Y239 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NOD1Q9Y239 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOD1Q9Y239 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOD1Q9Y239 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NOD1Q9Y239 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOD1Q9Y239 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOD1Q9Y239 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOD1Q9Y239 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOD1Q9Y239 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOD1Q9Y239 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NOD1Q9Y239 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NOD1Q9Y239 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOD1Q9Y239 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOD1Q9Y239 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOD1Q9Y239 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOD1Q9Y239 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOD1Q9Y239 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOD1Q9Y239 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOD1Q9Y239 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOD1Q9Y239 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOD1Q9Y239 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NOD1Q9Y239 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOD1Q9Y239 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOD1Q9Y239 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOD1Q9Y239 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOD1Q9Y239 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOD1Q9Y239 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOD1Q9Y239 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOD1Q9Y239 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOD1Q9Y239 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms