Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDHA12Q9UN75 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDHA12Q9UN75 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDHA12Q9UN75 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDHA12Q9UN75 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDHA12Q9UN75 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDHA12Q9UN75 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDHA12Q9UN75 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDHA12Q9UN75 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDHA12Q9UN75 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDHA12Q9UN75 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDHA12Q9UN75 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDHA12Q9UN75 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDHA12Q9UN75 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDHA12Q9UN75 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDHA12Q9UN75 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDHA12Q9UN75 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDHA12Q9UN75 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDHA12Q9UN75 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDHA12Q9UN75 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCDHA12Q9UN75 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCDHA12Q9UN75 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PCDHA12Q9UN75 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCDHA12Q9UN75 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCDHA12Q9UN75 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCDHA12Q9UN75 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDHA12Q9UN75 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PCDHA12Q9UN75 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDHA12Q9UN75 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDHA12Q9UN75 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDHA12Q9UN75 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDHA12Q9UN75 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDHA12Q9UN75 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDHA12Q9UN75 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDHA12Q9UN75 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDHA12Q9UN75 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDHA12Q9UN75 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PCDHA12Q9UN75 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCDHA12Q9UN75 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCDHA12Q9UN75 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCDHA12Q9UN75 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCDHA12Q9UN75 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCDHA12Q9UN75 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms